blastn 2.2.15 [Oct-15-2006]
Query = AO080547000075 Isopentenyl pyrophosphate:dimethylallyl pyrophosphate isomerase
(819letters)
Database : ../blast-2.2.15/db/ESTclones
16689 sequences; 9902319 total letters
BLASTScope PARAMETERS:
Sort Element : queryFrom (ascending)
| HitNo | Definition | Score (bits) |
E-Val | From | To | Direction |
| 1 | JZ9205 | 1073 | 0.0E0 | 1 | 541 | 0 |
| 3 | JZ5872 | 738 | 0.0E0 | 1 | 390 | 0 |
| 4 | JK0386 | 673 | 0.0E0 | 245 | 583 | 0 |
| 2 | JZ4770 | 803 | 0.0E0 | 415 | 819 | 0 |
>JZ9205
Length = 574
Score = 1073 bits (541.0), Expect = 0.0
Identities = 541/541 (100.00%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ATGAGCGTAACTACTACAACCACCGAGCCCCCTAGAATCACGGCGGAGAATGTCGCCACT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 34 ATGAGCGTAACTACTACAACCACCGAGCCCCCTAGAATCACGGCGGAGAATGTCGCCACT 93
Query: 61 CTCTTCCCAGAGGTCGATACTTCTTTGGCTCGTGAAGTCCTCCCAAAAGCCGATGGCAAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94 CTCTTCCCAGAGGTCGATACTTCTTTGGCTCGTGAAGTCCTCCCAAAAGCCGATGGCAAT 153
Query: 121 CCCTCCGCAGCTAGCAGCAACGAGCTGGCGGGTTATGACGACGAACAGGTCCGTCTAATG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 154 CCCTCCGCAGCTAGCAGCAACGAGCTGGCGGGTTATGACGACGAACAGGTCCGTCTAATG 213
Query: 181 GATGAAGTATGCATCGTTCTGGATGATGATGACAAGCCTATTGGAAGTGCCAGCAAGAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 GATGAAGTATGCATCGTTCTGGATGATGATGACAAGCCTATTGGAAGTGCCAGCAAGAAG 273
Query: 241 ACCTGCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 ACCTGCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTTC 333
Query: 301 CTCTTCGATTCCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 CTCTTCGATTCCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATTC 393
Query: 361 CCAGATATGTGGACAAACACTTGCTGCTCTCACCCTCTTGGAATTGCTGGCGAGACCGGT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 CCAGATATGTGGACAAACACTTGCTGCTCTCACCCTCTTGGAATTGCTGGCGAGACCGGT 453
Query: 421 TCTGAGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTGGAACAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 TCTGAGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTGGAACAT 513
Query: 481 GAGCTTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACGAGAATA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 GAGCTTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACGAGAATA 573
Query: 541 C 541
|
Sbjct: 574 C 574
| PageTop |
>JZ5872
Length = 438
Score = 738 bits (372.0), Expect = 0.0
Identities = 387/391 (98.98%), Gaps = 1/391(0.26%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ATGAGCGTAACTACTACAACCACCGAGCCCCCTAGAATCACGGC-GGAGAATGTCGCCAC 59
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 48 ATGAGCGTAACTACTACAACCACCGAACCCCCTAGAATCACGGCTGGAGAATGTCGCCAC 107
Query: 60 TCTCTTCCCAGAGGTCGATACTTCTTTGGCTCGTGAAGTCCTCCCAAAAGCCGATGGCAA 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 108 TCTCTTCCCAGAGGTCGATACTTCTTTGGCTCGTGAAGTCCTCCCAAAAGCCGATGGCAA 167
Query: 120 TCCCTCCGCAGCTAGCAGCAACGAGCTGGCGGGTTATGACGACGAACAGGTCCGTCTAAT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 168 TCCCTCCGCAGCTAGCAGCAACGAGCTGGCGGGTTATGACGACGAACAGGTCCGTCTAAT 227
Query: 180 GGATGAAGTATGCATCGTTCTGGATGATGATGACAAGCCTATTGGAAGTGCCAGCAAGAA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 228 GGATGAAGTATGCATCGTTCTGGATGATGATGACAAGCCTATTGGAAGTGCCAGCAAGAA 287
Query: 240 GACCTGCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTT 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 288 GACCTGCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTT 347
Query: 300 CCTCTTCGATTCCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATT 359
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 348 CCTCTTCGATTNCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATT 407
Query: 360 CCCAGATATGTGGACAAACACTTGCTGCTCT 390
|||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 408 CCCAGATATGTGGACAAACACTCGCTGCTCT 438
| PageTop |
>JK0386
Length = 556
Score = 673 bits (339.0), Expect = 0.0
Identities = 339/339 (100.00%)
Strand = Plus / Plus
Query: 245 GCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTTCCTCT 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8 GCCACCTCATGACCAACATTGACCGCGGCCTTCTCCACCGTGCCTTTTCCGTGTTCCTCT 67
Query: 305 TCGATTCCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATTCCCAG 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 68 TCGATTCCAACAAGCGCTTGCTTCTCCAACAGCGCGCCACTGAGAAGATTACATTCCCAG 127
Query: 365 ATATGTGGACAAACACTTGCTGCTCTCACCCTCTTGGAATTGCTGGCGAGACCGGTTCTG 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 128 ATATGTGGACAAACACTTGCTGCTCTCACCCTCTTGGAATTGCTGGCGAGACCGGTTCTG 187
Query: 425 AGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTGGAACATGAGC 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 188 AGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTGGAACATGAGC 247
Query: 485 TTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACGAGAATACATT 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 248 TTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACGAGAATACATT 307
Query: 545 ACAAGGCTCCTAGTGATGGGAAGTGGGGAGAGCATGAGA 583
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 308 ACAAGGCTCCTAGTGATGGGAAGTGGGGAGAGCATGAGA 346
Score = 272 bits (137.0), Expect = 0.0
Identities = 144/145 (99.31%), Gaps = 1/145(0.69%)
Strand = Plus / Plus
Query: 584 TCGACTATATTCTCTTCATCCAGGCAGATGTAGAGCTGAAGCCTAGCCC-GAATGAGGTT 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 412 TCGACTATATTCTCTTCATCCAGGCAGATGTAGAGCTGAAGCCTAGCCCCGAATGAGGTT 471
Query: 643 CGAGACACGAAGTACGTCTCGGCTGACGAATTGAAGACGATGTTTGAGCAGCCGGGGTTG 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 CGAGACACGAAGTACGTCTCGGCTGACGAATTGAAGACGATGTTTGAGCAGCCGGGGTTG 531
Query: 703 AAATTCACGCCTTGGTTCAAACTTA 727
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 AAATTCACGCCTTGGTTCAAACTTA 556
| PageTop |
>JZ4770
Length = 583
Score = 803 bits (405.0), Expect = 0.0
Identities = 405/405 (100.00%)
Strand = Plus / Plus
Query: 415 ACCGGTTCTGAGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTG 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ACCGGTTCTGAGCTGGATGCCGCTATCTTGGGCGTGAAGCGGGCTGCGCAGCGGAAGTTG 60
Query: 475 GAACATGAGCTTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACG 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GAACATGAGCTTGGAATTAAGCCGGAGCAAGTACCCCTGGATAAGTTCGATTTCTTCACG 120
Query: 535 AGAATACATTACAAGGCTCCTAGTGATGGGAAGTGGGGAGAGCATGAGATCGACTATATT 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 AGAATACATTACAAGGCTCCTAGTGATGGGAAGTGGGGAGAGCATGAGATCGACTATATT 180
Query: 595 CTCTTCATCCAGGCAGATGTAGAGCTGAAGCCTAGCCCGAATGAGGTTCGAGACACGAAG 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 CTCTTCATCCAGGCAGATGTAGAGCTGAAGCCTAGCCCGAATGAGGTTCGAGACACGAAG 240
Query: 655 TACGTCTCGGCTGACGAATTGAAGACGATGTTTGAGCAGCCGGGGTTGAAATTCACGCCT 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 TACGTCTCGGCTGACGAATTGAAGACGATGTTTGAGCAGCCGGGGTTGAAATTCACGCCT 300
Query: 715 TGGTTCAAACTTATCTGCAATTCGATGTTGTTCGAATGGTGGAGCCATCTCGGCTCTCCA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 TGGTTCAAACTTATCTGCAATTCGATGTTGTTCGAATGGTGGAGCCATCTCGGCTCTCCA 360
Query: 775 ACCCTGGAGAAGTACAAGGGCGAGAAAGGTATCCGGCGTATGTGA 819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ACCCTGGAGAAGTACAAGGGCGAGAAAGGTATCCGGCGTATGTGA 405
| PageTop |